Na južnim padinama Marjana 1951. godine osnovan je Botanički vrt. Tu su bile zasađene brojne biljke tropskih i suptropskih područja, a u sjevernom dijelu vrta nalazila se autohtona mediteranska flora. Botanički vrt nije bio samo pedagoška ustanova već i promotor uzgoja i njege biljaka. Početkom 60-tih godina prošloga stoljeća uspješno je surađivao s brojnim botaničkim ustanovama diljem svijeta. Vrt je napredovao do 80-ih kada, nažalost, započinje njegovo propadanje. Odjel za biologiju Prirodoslovno-matematičkog fakulteta angažirao se na njegovoj obnovi.

Cilj restauracije i obnove zapuštenog vrta u sklopu projekta “Marjan 2020 – Brdo prošlosti, oaza budućnosti” je pretvoriti ga u interpretacijski centar botanike sa brojnim novim sadržajima i to multimedijalnim i botaničkim sadržajima edukacijskog tipa. Tako će preuređeni Botanički vrt biti primarno namijenjen edukaciji posjetitelja o prirodi, bioraznolikosti botaničkog svijeta, s naglaskom na mediteransko područje, a samim time i povećavanju svijesti posjetitelja o potrebi očuvanja prirodne baštine i njenog održivog korištenja.